En primer lugar, hay un pequeño error en tu razonamiento. Has dicho que el carbanión es más estable en el lado no sustituido, pero en realidad, la formación de un enolato en el lado más sustituido dará un alqueno sustituido más estable. Recuerda que la carga negativa no se concentra en el carbono. Se concentra en el átomo de oxígeno ya que el sistema está conjugado. Por eso las interacciones electrostáticas tienden a producirse en el oxígeno mientras que las interacciones orbitales (HOMO-LUMO) se producen en el carbono.
Ahora bien, una cetona asimétrica puede formar dos enolados regioisoméricos, cinéticos y termodinámicos:
El enolato cinético es el que se forma más rápidamente. A menudo, es promovido por el LDA, que es una base fuerte pero obstaculizada, a bajas temperaturas, típicamente $\pu{-78^\circ C}$ . Al estar más impedido, atacará al hidrógeno alfa, menos impedido y más accesible, y formará el enolato menos sustituido.
Por otro lado, los enolados termodinámicos tienden a formarse a temperaturas más altas con bases sin obstáculos como $\ce{NaH}$ .