En realidad, la redistribución de la fuerza entre las dos masas es la misma idea que la fuerza que se transmite internamente.
Dentro de un mismo objeto, cada "partícula" individual recibirá una fuerza adecuada para que sufra una aceleración igual a la del resto de las partículas del objeto. En este caso, las partículas se refieren a pequeñas partes del objeto, ya sean moléculas o átomos, pero el efecto es el mismo.
Como las dos masas están unidas por una cuerda, la fuerza total debe transmitirse a todas las partículas de la segunda masa de forma que todo el sistema sufra la misma aceleración. Los 10N y 40N no son más que los totales de las fuerzas sobre cada partícula de cada bloque por separado, del mismo modo que 50N es el total de todo el sistema.
Por otra parte, si la aceleración de dos masas no fuera la misma, entonces o bien la cuerda tendría que extenderse, lo que has afirmado que no es posible, o bien la cuerda perdería toda la tensión y se aflojaría, impidiendo que una de las masas se acelerara hasta que se cogiera la holgura y se recuperara la tensión.