Parece que el CRS está mal definido para una de las capas (o ambas).
Añade un mapa base desde el plugin QuickMapServices. Compara tus dos capas con el mapa base. Vea si alguna de sus capas está en la ubicación correcta o no. Concéntrese en corregir el CRS de cualquier capa que se muestre en la ubicación incorrecta en comparación con el mapa base de QMS.
Tendrá que averiguar qué CRS tiene cada capa debe estar en. Mira los metadatos del cuadrante topográfico y lee los ajustes de exportación y la documentación de la aplicación SW Maps. Una vez que averigüe en qué CRS debe estar esa capa, redefina el CRS de esa capa (en las propiedades de la capa).
Nota: Creo que esta es la mejor respuesta actualmente posible en base a la información que ha proporcionado hasta ahora . Si compruebas los metadatos (como se ha mencionado anteriormente) y actualizas tu pregunta con la información que encuentres, intentaré ofrecer una solución más específica.