La respuesta a su pregunta, sencillamente, es que la búsqueda de inteligencia extraterrestre en las ondas de radio es lo que se ha hecho paradigmáticamente durante más tiempo. Dicho de otro modo, es lo que más se ha hecho. En concreto, podemos remitirnos a la ecuación de Drake
$$ N = R_* \times f_p \times n_e \times \times f_l \times f_i \times f_c \times L $$
que ha motivado las búsquedas del SETI desde que se postuló por primera vez en 1961. Ahora, la ecuación de Drake no es más que una conjetura. De los siete términos implicados, sólo los dos primeros -la tasa media de formación de estrellas en nuestra galaxia y la fracción de estrellas que tienen planetas- son cosas para las que la astrofísica moderna nos ha dado estimaciones cuantitativas. El resto de los términos se refieren a nociones muy vagas como la fracción de planetas que pueden desarrollar vida, la fracción de planetas que realmente desarrollan vida, la fracción de esos que evolucionan en civilizaciones, etc. Es crucial, $f_c$ es la fracción de civilizaciones que pueden comunicarse mediante ondas de radio.
No hay más fundamento que el hecho de que Drake pensó que era una buena idea buscar en la banda de radio, y a estas alturas se han invertido millones de dólares en estas búsquedas. De hecho, asistí a una charla impartida por alguien del SETI sobre su reciente trabajo y, francamente, me pareció que todo su enfoque era muy deficiente.
En pocas palabras: lo siguen haciendo porque todavía pueden conseguir financiación para hacerlo y nadie ha defendido un uso más eficaz de esos recursos.