¿Cómo puedo evitar la superposición de etiquetas en un gráfico de R?

Question

Estoy tratando de etiquetar un gráfico de dispersión bastante simple en R. Esto es lo que uso:

plot(SI, TI)
text(SI, TI, Name, pos=4, cex=0.7)

El resultado es mediocre, como puedes ver (haz clic para ampliar):

Intenté compensar esto usando el textxy función, pero no es mejor . Hacer la imagen más grande no funciona para los grupos densos.

¿Hay alguna función o forma fácil de compensar esto y dejar que R trace etiquetas que no se superponen ?

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Aquí está un pequeño subconjunto de los datos que tengo:

Name;SI;TI
01_BAD_talking_head;6.944714;4.421208
01_GOOD_talking_head;5.680141;4.864035
01_GOOD_talking_head_subtitles;7.170114;4.664205

Answer 1

Vea el nuevo paquete ggrepel . ggrepel proporciona geom para que ggplot2 repela las etiquetas de texto superpuestas. Funciona tanto para geom_text como para geom_label.

La cifra está tomada de esta entrada del blog .

Answer 2

El directlabels paquete lo hace. Desde su página web :

Este paquete es un intento de hacer realidad el etiquetado directo en en la práctica estadística diaria, poniendo a disposición un conjunto de funciones que hacen que el etiquetado directo de gráficos comunes sea fácil de hacer con sistemas de trazado de alto nivel como lattice y ggplot2.

Sin embargo, no siempre es posible para las parcelas densas.

He aquí un breve ejemplo:

set.seed(123)
a <- c(rnorm(10,-3,2),rnorm(10,3,2))
b <- c(rnorm(10,-3,2),rnorm(10,3,2))
dfr <- data.frame(a,b)
dfr$t <- c(paste("A",1:10,sep=""),paste("B",1:10,sep=""))
direct.label(xyplot(b~a,dfr,groups=t, col="black"))

Conseguí deshacerme de la coloración del punto con col="black" pero no las etiquetas.

Answer 3

Te sugiero que eches un vistazo a la wordcloud paquete. Sé que este paquete no se centra exactamente en los puntos, sino en las propias etiquetas, y también el estilo parece ser bastante fijo. Pero aun así, los resultados que obtuve al usarlo fueron bastante impresionantes. También hay que tener en cuenta que la versión del paquete en cuestión fue lanzada más o menos cuando hiciste la pregunta, así que todavía es muy nueva.

http://blog.fellstat.com/?cat=11

Answer 4

Un par de herramientas adicionales para ver en R:

• El spread.labels en la función plotrix paquete
• thigmophobe.labels en el plotrix paquete
• el spread.labs en la función TeachingDemos paquete
• el TkIdentify en la función TeachingDemos paquete

Estos no lo harán todo por ti, pero uno de ellos puede ser parte de la solución.

Answer 5

En el caso de que simplemente no puede Para conseguir que las etiquetas funcionen correctamente tal y como las produce R, tenga en cuenta que siempre puede guardar los gráficos en un formato vectorial (como .pdf) y llevarlos a un programa de edición como InkScape o Adobe Illustrator.