Esto no es una respuesta sino un comentario largo, que además es ciertamente "subjetivo y argumentativo". Leyendo todas las historias dadas en las 12 respuestas, encuentro que puedo clasificarlas en tres categorías:
(1) las historias que no tienen ninguna base fáctica y son puros mitos (por ejemplo, la de Hilbert rechazado por Gordan, o el de Grothendieck rechazado por ya sabes quién, etc.). Me gustaría añadir a Fourier a esta categoría, pero aquí no conozco la historia lo suficientemente bien como para estar seguro. Lo que sí es cierto es que Cauchy, ante una contradicción entre el resultado de Fourier y un teorema que él "demostró" (el límite de una función continua s es continuo) no desestimó a Fourier, y que otros desestimaron rápidamente (con razón) el resultado de Cauchy.
(2) Las que no se refieren realmente a las matemáticas: Boltzmann, Bolzano (cuyo trabajo en matemáticas llegó a ser admirado tan pronto como se conoció, y fue controvertido por otra cosa), Giordano Bruno, e incluso Brouwer, que como matemático fue respetado e incluso admirado por casi todo el mundo, y sólo fue controvertido como filósofo de las matemáticas -y ciertamente no más de lo que es controvertido cualquier otro filósofo.
(3) Las pocas que tienen una base fáctica y que se refieren a las matemáticas. Limitaré mi atención a estos casos, ya que son los únicos que realmente responden a la pregunta. Ahora bien, Me temo que en cada una de estas historias, donde un genio romántico hace un descubrimiento que es ignorado o rechazado por el establecimiento conservador de las matemáticas Mi corazón está con ese supuesto establecimiento, al que no puedo acusar de ningún delito, ni siquiera con el beneficio de la retrospectiva. De hecho, en ninguno de estos casos el "genio romántico" ha sido perseguido o incluso intimidado (como lo fue, por ejemplo, Giordanno Bruno o, en menor medida, Galileo). Nosotros, la comunidad de matemáticos, no tenemos auto-da-fé (por no hablar de la hoguera) en nuestra historia para pedir perdón. Lo que ocurre en todos esos casos es que había un matemático genial cuyas obras adolecían de graves carencias, y era esas deficiencias y no los de la comunidad matemática, lo que hizo que el proceso de asimilación de estos trabajos por parte de la comunidad más largo de lo que podría haber sido.
Permítanme explicar mi punto de vista discutiendo algunos casos:
Lévy, como hemos dicho, era un gran probabilista, pero no muy riguroso. Estoy de acuerdo con esta descripción. Ahora bien, el hecho de que su trabajo no sea riguroso, ¿es una ventaja o una desventaja? Para mí la respuesta es obvia, y espero que todos los presentes estén de acuerdo con ello. Más o menos al mismo tiempo, Kolmogorov estaba fundando probabilidades abstractas rigurosas sobre la teoría de Lebesgue, y esto dio a sus teoremas un poder de convicción que los de Lévy no tienen. La comunidad matemática ha hecho en realidad un trabajo bastante bueno y relativamente rápido en hacer rigurosos los resultados de Lévy y ponerlos en la corriente principal de la teoría.
Cantor es un caso interesante. Un genio absoluto, sin duda, con observaciones a veces casi idiotas -- como cuando escribe a Dedekind que su biyección entre la línea y el plano refuta la idea básica de dimensión. Dedekind le responde amablemente que la gente que trabaja en geometría sólo considera funciones continuas. Ahora bien, es perfectamente normal y saludable que sus trabajos en teoría de conjuntos fueran expuestos a tan duras críticas en su época. Había serios problemas de fundamentación en lo que estaba haciendo. Desde el importante punto de vista del rigor, estaba devolviendo las matemáticas a la época del cálculo primitivo, olvidando todos los avances en el rigor realizados en el siglo XIX, y de hecho, había como es sabido ahora algunas graves paradojas ocultas en su teoría. Las duras críticas contra la obra de Cantor (como las de Poincaré) eran la antitesis en un proceso dialéctico, donde el papel de la síntesis lo jugaban los amantes del paraíso de Cantor, que no querían perder el rigor y admitir las paradojas. Hilbert se vio obligado por esas mismas críticas a desarrollar un programa matemático de gran alcance para despejar las incoherencias descubiertas. Ahora, el fracaso parcial del programa de Hilbert (los teoremas de incompletitud e inconsistencia de Gödel) muestra que realmente había algo podrido en el paraíso de Cantor, y la indecidibilidad del problema favorito de Cantor (la hipótesis del continuo) da peso retrospectivamente a la crítica de Poincaré: podría decirse que Poincaré nunca planteó una cuestión que luego se demostrara indecidible, a diferencia de lo que ocurre con la hipótesis del continuo o las cuestiones del género de los ángeles.
¿Galois? Bueno, tiene las mejores excusas posibles para haber escrito sus geniales descubrimientos de una manera tan ilegible: los escribió en parte en la cárcel, en parte la noche antes de su muerte, y todo ello antes de cumplir los 22 años. Ahora bien, por las mismas razones, el establishment matemático (la "Académie des Sciences", incluyendo a personas con una mente muy diferente, como Fourier) tiene buenas excusas para no entender lo que había hecho inmediatamente. Y de nuevo, muy poco después de su muerte (unos 10 años después), su obra fue exhumada, intensamente admirada e integrada en la matemática viva (especialmente por la escuela alemana).
PD: por favor, siéntase libre de votar este post poco romántico. Mi yo anterior probablemente lo habría hecho.