Estoy utilizando el producto MODIS NDVI (MOD13Q1) para el estudio de los cambios en la vegetación. Quiero eliminar los píxeles nublados o malos de los datos MODIS NDVI. No consigo ningún método o software adecuado o cualquier programa para realizar esta tarea.
Aunque requiere el registro de una cuenta, puedes hacerlo a través de la API de Google Earth Engine con bastante facilidad. Ofrecen completos tutoriales y scripts sobre cómo hacerlo, así como los productos de datos que solicitas. Puedes eliminar los píxeles nublados/malos del producto NDVI ajustando el script de este tutorial para las capas de datos que quieras utilizar: https://developers.google.com/earth-engine/ic_composite_mosaic
Como sé, hay una banda de control de calidad en el producto MOD13Q1. puede comprobar en este enlace Indica si el píxel está cubierto de nieve o de nubes.
Este grupo de la Universidad de Colorado supervisa las mareas de tempestad y las inundaciones a nivel mundial utilizando el sistema MODIS. Podrías consultar sus publicaciones para conocer su relación con las nubes... Sé que utilizan imágenes de varios días, tanto de Terra como de Aqua, para elaborar sus productos.
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¿Hay alguna razón por la que no utilice la capa de calidad suministrada junto con la capa NDVI? La forma más fácil de acceder a la información de esos datos es utilizando las herramientas LDOPE: lpdaac.usgs.gov/tools/ldope_tools