Las ecuaciones EL para su potencial propuesto serían
$$m\ddot q -\frac{d}{dt}\frac{\partial U}{\partial \dot q}= \frac{\partial U}{\partial q}$$ que puede reexpresarse como $$\left(m- \frac{\partial^2 U}{\partial \dot q^2} \right)\ddot q = -\frac{\partial U}{\partial q} +\frac{\partial^2 U}{\partial q \partial \dot q} \dot q$$
Dependencia no lineal de $U$ en $\dot q$ por lo tanto, daría lugar a un término de masa dinámica efectiva, mientras que la dependencia cruzada de $q$ y $\dot q$ daría una fuerza dependiente de la velocidad, que podría describir alguna forma de fricción del fluido o la fuerza de Lorentz, como mencionas en la pregunta original.
Sin embargo, hay que tener en cuenta que la adición de esta dependencia de la velocidad podría hacer que la matriz hessiana $\frac{\partial ^2 L}{\partial \dot q^i \partial \dot q^j}$ singular. En este caso, la transición al marco hamiltoniano a través de la transfomación de Legendre debe abordarse con mucha más cautela; véase, por ejemplo, la esta pregunta .
Consideremos el lagrangiano relativista
$$L = mc^2 \sqrt{1-\frac{v^2}{c^2}} - U(\mathbf x)$$
Expandiendo a segundo orden en $v^2/c^2$ esto se convierte en
$$L = \frac{1}{2} mv^2 +\frac{3}{8} m v^4/c^2 - U(\mathbf x)$$ lo que da lugar a las ecuaciones EL $$-\frac{\partial U}{\partial \mathbf x} = \frac{d}{dt}\left[m\left(1+ \frac{3v^2}{2c^2} \right)\mathbf v\right]$$ Esto es mecánica newtoniana, excepto que $m$ ha sido sustituido por $m\left(1+\frac{3v^2}{2c^2}\right)$ , dando la corrección relativista de menor orden.