Estoy interesado en examinar cómo cambia la diversidad de especies de las comunidades de aves tras la tala de árboles y he utilizado Vegan en R para realizar mis análisis. A continuación se muestra una muestra de mis datos de recuento. Los nombres de las parcelas están en las columnas y los recuentos de las especies correspondientes están en las filas (las especies son un código de 4 letras).
SRSFC1_post SRSFC1_pre SRSFT1_post SRSFT1_pre SRSFT2_post
AMRE 0 0 1 0 0
AMRO 5 1 5 12 1
BCCH 1 2 1 3 4
BHCO 0 0 0 0 0 He calculado el índice de Shannon para cada parcela, pero no he podido calcular los errores estándar de los índices. ¿Puede alguien aconsejarme sobre cómo calcular el error estándar para el índice de Shannon en R? Si se necesitan más detalles, por favor hágamelo saber y gracias de antemano.
Actualización - He utilizado el bootstrapping para calcular los intervalos de confianza, así como para comparar con los índices de Shannon para las comunidades de aves antes y después de la cosecha. Según tengo entendido, el bootstrapping funciona esencialmente tomando repetidamente una submuestra de un conjunto de datos, y los intervalos de confianza pueden calcularse utilizando estos conjuntos de datos.
Para la gente que tiene preguntas similares, he encontrado el libro de Mark Gardener 'Community Ecology: Analytical Methods Using R and Excel' es un recurso excelente. Este tema se aborda en el capítulo 9 y el código R se proporciona (he utilizado el código en la página 237).
Página web de libros: http://www.gardenersown.co.uk/Education/Lectures/Community%20Ecology%20Support%20Files.htm
