Estoy buscando un software o paquete de software (por ejemplo, C/C++) que pueda simular una gran cantidad (digamos miles al menos) de moléculas en acción (es decir, en movimiento o conectadas a paredes estáticas).
He encontrado varios, pero parece ser o "sólo gas", "sólo agua", o no realmente científico (un montón de pequeñas bolas esquivando alrededor movido por una fórmula única).
El paquete apropiado de mecánica molecular en un entorno gráfico es Abalone.
Admite una serie de métodos estándar como la dinámica molecular, la optimización, además de cosas como Hybrid Monte Carlo. Entorno gráfico conveniente, varios métodos para la construcción de modelos. Se ejecuta rápidamente, especialmente cuando la tarjeta de vídeo se utiliza como acelerador de cálculo.
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