Estoy usando ArcGIS Desktop 10.0.
Tengo un truco para eliminar los agujeros de la rosquilla, que es convertir el polígono en línea y luego crear un polígono fuera de las líneas y al final fusionar todas ellas. El inconveniente de esta estrategia es que elimina otros agujeros y áreas vacías que en realidad están vacías y deben mantenerse vacías. Vea la siguiente imagen: