Empezar con
$$
\begin{align}
\mathrm{Li}_2(x)
&=-\int_0^x\frac{\log(1-t)}{t}\,\mathrm{d}t\\
&=\mathrm{Li}_2\left(\frac12\right)-\int_{1/2}^x\frac{\log(1-t)}{t}\,\mathrm{d}t\\
&=\mathrm{Li}_2\left(\frac12\right)+\int_{1-x}^{1/2}\frac{\log(t)}{t-1}\,\mathrm{d}t\\
&=\mathrm{Li}_2\left(\frac12\right)+2\int_{1/2-x/2}^{1/4}\frac{\log(2)+\log(t)}{2t-1}\,\mathrm{d}t\\
&=\mathrm{Li}_2\left(\frac12\right)-\log(2)\log(2x)+2\int_{1/2-x/2}^{1/4}\frac{\log(t)}{2t-1}\,\mathrm{d}t\tag{1}
\end{align}
$$
Sustituyendo $x\mapsto1-2x$, obtenemos
$$
\mathrm{Li}_2(1-2x)
=\mathrm{Li}_2\left(\frac12\right)-\log(2)\log(2-4x)+2\int_x^{1/4}\frac{\log(t)}{2t-1}\,\mathrm{d}t\tag{2}
$$
lo que da
$$
\begin{align}
\hskip{-6mm}\int_1^x\frac{\log(t)}{2t-1}\,\mathrm{d}t
&=-\frac{\pi^2}{24}-\frac{\log(2)}2\log(2x-1)-\frac12\mathrm{Li}_2(1-2x)\\
&=\frac{\pi^2}{24}+\frac14\log(2x-1)^2-\frac{\log(2)}2\log(2x-1)+\frac12\mathrm{Li}_2\left(\frac1{1-2x}\right)\tag{3}
\end{align}
$$
donde hemos aplicado la Inversión de la Fórmula para $\mathrm{Li}_2$, demostrado en esta respuesta.
El uso de Euler-Maclaurin de la Suma de la Fórmula, obtenemos
$$
\begin{align}
\hskip{-6mm}\sum_{k=1}^n\frac{\log(k)}{2k-1}
&\sim C_1+\frac14\log(2n-1)^2-\frac{\log(2)}2\log(2n-1)+\frac12\mathrm{Li}_2\left(\frac1{1-2n}\right)\\
&+\frac12\frac{\log(n)}{2n-1}+\frac1{12}\left(\frac1{n(2n-1)}-\frac{2\log(n)}{(2n-1)^2}\right)\\
&-\frac1{720}\left(\frac2{n^3(2n-1)}+\frac6{n^2(2n-1)^2}+\frac{24}{n(2n-1)^3}-\frac{48\log(n)}{(2n-1)^4}\right)\tag{4}
\end{align}
$$
La expansión asintótica en $(4)$ contiene términos con a $3$ derivados de $\frac{\log(x)}{2x-1}$. El uso de la expansión que contiene términos con a $11$ derivados, y el uso de $n=1000$, se puede calcular
$$
C_1=0.348321017592010450605888035840979159864320\etiqueta{5}
$$
La combinación de $(5)$ y
$$
\frac14\log(2n-1)^2-\frac{\log(2)}2\log(2n-1)=\frac{\log(n)^2}4-\frac{\log(2)^2}4+O\left(\frac{\log(n)}n\right)\tag{6}
$$
obtenemos la constante a se $C_2=C_1-\frac{\log(2)^2}4$
$$
C_2=0.228207764112460094439112404259312916931681\etiqueta{7}
$$
Todavía no he encontrado una forma cerrada para $C_2$, pero si se encuentra uno, se puede utilizar $(7)$ para la confirmación.