Referencia: http://www.stat.wisc.edu/~bates/UseR2008/WorkshopD.pdf de la página 120.
Ahora quiero ajustar un modelo logístico mixto generalizado, donde $\beta$ es un efecto fijo, $\theta$ es el parámetro de covarianza de la varianza de los efectos aleatorios, $u$ son los efectos aleatorios, $\tilde{u}$ son los efectos aleatorios empíricos. La función de verosimilitud es $$L(\theta, \beta \mid y) = \int p(y \mid X,\beta, Z, u) \; p(u \mid \theta) \, du.$$
No entiendo cómo los efectos fijos $\beta$ y los parámetros de varianza de los efectos aleatorios $\theta$ son estimados. Según las diapositivas, primero utilizan el método de cuadrados iterativos reponderados penalizados para estimar $\tilde{u}(y|\theta,\beta)$ y luego utilizar la aproximación de Laplace y el método de máxima verosimilitud para la desviación máxima $d(\beta,\theta|y)$ . La desviación es una función de $y,\tilde{u}$ , entonces una función de $y,\beta,\theta$ .
Desde mi punto de vista, $\tilde{u}$ no es una forma cerrada. Cómo podemos mamimizar una función en la que la función incluye un algoritmo PIRLS?