Las diferencias en las covariables de referencia no son intrínsecamente malas. Dado el pequeño tamaño de la muestra, y el posible número de "covariables" comparadas, es casi seguro que una o más mostrarán "desequilibrio" - pero eso es sólo un artefacto de una tasa de error familiar no controlada - y hey, ¿cuál es el punto final primario ¿de todos modos?
Lo más útil es pensar en la hipótesis de la aleatorización no como un equilibrio de una lista posiblemente infinita de covariables, sino como un equilibrio de su "efecto medio" en cada grupo; exactamente la razón de ser del emparejamiento por propensión. Stephen Senn ha escrito ampliamente sobre esta cuestión como uno de los principales "mitos" de los ensayos clínicos, y debemos deducir por la convención de "tratado" y "control" que se trata de un estudio aleatorio. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/sim.5713
El Dr. Senn continúa explicando que el desequilibrio es muy diferente de la confusión, ya que aunque la variable esté asociada al resultado, en teoría no está relacionada con la aleatorización, a menos que haya algún tipo de análisis condicional como en la población "por protocolo". A pesar de todo esto, el ajuste prevalece como la forma superior de manejar el desequilibrio porque, dado que la variable condicionada es pronóstica -es decir, que realmente predice el resultado-, la tendencia es aumentar poder. Las variables que no son fuertemente predictivas de la respuesta tienden a atenuar la potencia de la prueba cuando se ajusta a discreción.
Pero todo esto se va a la basura si no se trata de un análisis preestablecido. Esto se debe a que no puedes elegir el análisis que finalmente haces basándote en lo que ves en los datos. Haz el análisis que tenías previsto, probablemente sea el correcto.