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Resultados de Qvalue.R

Tengo algunos valores p que quiero convertir en valores q. El problema con el que me encuentro es que los valores q generados por el paquete qvalue de storey están todos en un rango muy estrecho (es decir, de 0,25 a 0,35).

No estoy seguro de lo que esto significa. Estoy trabajando con un conjunto de datos ridículamente pequeño, dado el número de hipótesis, ¿podría ser ese el problema? Podría entenderlo si tuviera todos los valores q altos, pero que todos tengan un valor q de ~.25... Estoy perdido.

Agradecería mucho que alguien me explicara qué es lo que no estoy entendiendo aquí sobre los valores q.

Gracias.

Editar:

Un histograma de los valores p

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Estadísticas descriptivas

  • cuenta 249.000000
  • media 0,395376
  • std 0,263631
  • min 0,006288
  • 25% 0.173421
  • 50% 0.351731
  • 75% 0.588190
  • máx. 1,000000

Dispersión

  • p-val < .2 0.026
  • p-val > .2 0.092

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JohnRos Puntos 3211

Como los valores q de Storey son estimaciones del pFDR, con la interpretación bayesiana de "la probabilidad del nulo dados los datos", mi conjetura es que la distribución alternativa estimada tiene una alta varianza de modo que casi todos los valores alejados del nulo tienen un pFDR similar.

¿Sus valores p están muy repartidos, salvo una concentración cercana a 0?

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