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¿Qué formatos de archivos químicos son compatibles con la impresión 3D?

Me gustaría imprimir algunas moléculas en lugar de construirlas con un kit. ¿Qué formatos de archivo funcionan?

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Ninguno de los formatos de archivos químicos suele ser aceptado por los servicios de impresión 3D. La razón es que los formatos de los archivos químicos son fundamentalmente diferentes de los que describen objetos 3D.

En el caso más sencillo, un formato de archivo químico describe una lista de átomos y sus posiciones (además de posibles metadatos). Un ejemplo es el formato XYZ, que almacena exactamente eso. Otros "objetos químicos" que también pueden describirse en algunos formatos de archivos químicos son los enlaces, la estructura de las proteínas, la información sobre la estructura cristalina (celda unitaria, simetría, ocupación de cada posición atómica, ), etc.

En cambio, los formatos de archivo 3D describen una serie de objetos. En el caso más sencillo (por ejemplo, el formato STL o el formato de archivo Wavefront .obj), no se almacena el objeto en sí, sino una superficie triangulada no estructurada que delimita el objeto. En ellos, no se puede describir una esfera, sino sólo una teselación de la esfera.

Por lo tanto, es necesario un paso de conversión para crear una representación 3D de su estructura química. Los formatos de archivos químicos no suelen contener información de representación: tienes que elegir el que quieras (CPK, regaliz, caricatura de proteína, ) y utilizar un software para crear una escena 3D. VMD por ejemplo, permite exportar al formato STL, que es adecuado para la impresión en 3D.

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