incorporación de réplicas biológicas en el ANOVA unidireccional

Question

Estoy midiendo una propiedad particular de los gusanos (por ejemplo, longitud, velocidad, ...). Los gusanos están subdivididos en 3 tratamientos (cepas genéticas) y cada grupo de tratamiento consta de 15 individuos. Repliqué el experimento 3 veces, midiendo la propiedad dada en cada tratamiento durante 3 días seguidos. Tenga en cuenta que no medí el mismo individuo varias veces, los gusanos se tiraron a la basura al final del día y se utilizaron gusanos frescos al día siguiente.

Según mi interpretación, dado que medí cada individuo una sola vez, hice 3 réplicas biológicas y no 3 réplicas técnicas. Continué fusionando los datos de las 3 réplicas y opté por un ANOVA de una vía con la "cepa genética" como único factor.

Mi supervisor, sin embargo, cree que fusionar las réplicas y no incorporarlas al análisis ANOVA reducirá la potencia de la prueba. Por lo tanto, estoy buscando una respuesta estadísticamente bien respaldada a esta cuestión. ¿Debo continuar fusionando las réplicas o debo incorporarlas en el análisis?

P.D. Tengo la misma duda al hacer una prueba t (en ese caso, 3 réplicas de 2 cepas genéticas).

Answer 1

Parece que está tratando los días (dentro de los tratamientos) como bloques. Es posible que haya razones para hacerlo, aunque no nos las haya dicho. Así que deje que los datos decidan si realmente es diferencias entre bloques, y utilizar un modelo mixto, con interceptos aleatorios para los bloques. En R esto podría escribirse algo como

mod0 <- lme4::lmer(Y ~ treatment + (1 | day:treatment), data=your_data_frame)
summary(mod0)

y luego mirar la varianza estimada del efecto aleatorio para ver si hay evidencia de efectos de bloque.