Cuando los multímetros están en modo de prueba de resistencia, conectan su batería a la salida a través de una resistencia alta (tal vez del orden de 200kOhm si no más), y luego miden el efecto que la carga tiene en el voltaje - si la carga es de muy alta resistencia, leerá cerca del voltaje de suministro completo, si la carga es de muy baja resistencia, leerá cerca de cero.
Lo que esto significa es que si conectas una fuente de voltaje a la entrada en este modo, no debería hacer ningún daño (a menos que esté fuera del rango para el que está especificado el DMM, que 4V o así definitivamente no lo será) porque la alta resistencia de la fuente de voltaje interna limitará cualquier flujo de corriente.
TL;DR; no habrás hecho ningún daño.
Actualización:
Aunque este es el esquema de un multímetro fluke 87, el tuyo seguramente será muy similar. He resaltado los interruptores que están cerrados para el modo de medición de resistencia, y también para referencia las altas resistencias que están protegiendo la entrada (y que significarán que no has hecho ningún daño):