R: Random Forest lanzando NaN/Inf en el error "llamada a función extranjera" a pesar de que no hay NaN's en el conjunto de datos

Question

Estoy usando caret para ejecutar un bosque aleatorio validado de forma cruzada sobre un conjunto de datos. La variable Y es un factor. No hay NaN, Inf o NA en mi conjunto de datos. Sin embargo, al ejecutar el bosque aleatorio, obtengo

¿Alguien tiene ideas sobre si este error es causado por los NA introducidos por la coerción? Si es así, ¿cómo puedo evitar tal coerción?

Answer 1

Debe haber algunas características en su conjunto de entrenamiento con la clase 'char' .

Por favor, compruebe esto

> a <- c("1", "2",letters[1:5], "3")
> as.numeric(a)
[1]  1  2 NA NA NA NA NA  3
Warning message:
NAs introduced by coercion

Answer 2

Probablemente la causa es que tienes algunas variables de carácter en tu marco de datos.

Convierte todas las variables de carácter en factor en una sola línea:

library(dplyr) data_fac=data_char %>% mutate_if(is.character, as.factor)

Answer 3

Como se muestra en la advertencia, había 28 errores, que resultaban ser el número de columnas con tipos de datos de carácter ("chr"). Al forzar estas columnas a factores se pudo iniciar la ejecución.