Es posible hacer algunas cosas bastante inteligentes en las versiones más recientes de qgis2threejs.
Los objetos no tienen que estar sobre el MDE, pueden flotar por encima de él (utilizando una constante o un valor de campo numérico), como en la configuración que se muestra a continuación...
Cosas como los aerogeneradores se pueden utilizar para los símbolos de puntos, si se utiliza el formato COLLADA 3d (por ejemplo, exportado desde Blender o Sketchup)
Por ejemplo, puedes hacer "árboles" añadiendo esferas ligeramente por encima del suelo, y cilindros en el suelo.
Por ejemplo, la entrada del blog Más aventuras con el SIG 3D de Nicholas Duggan muestra lo que se puede hacer y cómo conseguirlo.
Sin embargo, no puedes animarlos, así que dudo que puedas hacer girar tus turbinas de viento ;)