Se me ocurren varias razones por las que esto podría ocurrir.
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La relación entre el logit del VD y el IV no es monótona, ya sea con el IV original o con el logaritmo del IV o con ambos, y al tomar el logaritmo cambia el signo de la relación lineal. En este caso, debe modelar la relación utilizando términos polinómicos o un spline.
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El IV tiene valores atípicos que afectan a las cosas de manera diferente cuando se registra.
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El IV es casi colineal con uno de los otros IVs, ya sea cuando se registra o en su forma original.
En cualquier caso, debería decidir si registrar el IV basándose en motivos de fondo y luego trabajar para encontrar un buen modelo. Los ingresos se registran a menudo porque pensamos en los ingresos de forma multiplicativa en lugar de aditiva. Es decir, si usted está haciendo \$20,000 and get a \$ 5.000 de aumento, eso es enorme. Si usted está haciendo \$200,000 and get a \$ 5.000 de aumento, no lo es.