Acabo de empezar a probar y utilizar CartoDB, y me encuentro con este problema en un mapa ya publicado:
http://deix.is/ueberwachungsstatistik/
He hecho pequeñas correcciones en el código HTML infowindow personalizado, y ahora
a) las infowindows en FF se extienden verticalmente hasta el extremo.
b) todas las capas aparecen como "visibles", aunque sólo 2 de las 4 capas deberían estarlo - en la interfaz de CartoDB, sólo 2 son visibles, el resto está oculto. Tampoco importa cuál sea.
¿Quizá los dos problemas estén relacionados? He probado a refrescar, comprobar y volver a pegar el código, y realmente no conozco la solución.