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Modelo no lineal en lme4

Voy a intentar ajustar un modelo de efectos mixtos no lineales $(A + B*e^t)$ en lme4. Ya he intentado ajustar este modelo en nlme con cierta dificultad debido al ruido de los datos. Sin embargo, entiendo que lme4 tiene algoritmos más robustos que son capaces de ajustar mejor los modelos no lineales como el escrito anteriormente.

He preparado unos cuantos puestos como ¿Cómo elegir la biblioteca R nlme o lme4 para los modelos de efectos mixtos?

Mi pregunta: ¿Es mejor lme4 que nlme con modelos no lineales? (nlme vs nlmer)

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¿Cuál es su criterio de "mejor"?

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@goangit, Por "mejor", ¿es más flexible en términos de convergencia y ajuste de modelos a datos que tienen mucho ruido? He notado que el algoritmo de nlme no es tan flexible y he tenido grandes dificultades con el ajuste de modelos a datos ruidosos.

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Ben Bolker Puntos 8729

No sé si esto se discute o se trata anteriormente en otro lugar, pero las principales diferencias son:

  • estructura en los residuos (favorece nlme ): como en el caso del lme contra. lmer comparación, nlme puede utilizarse junto con el paquete corStruct y varStruct capacidad de ajustar modelos con autocorrelación y heteroscedasticidad
  • documentación (favorece nlme ): nlme está bien documentado en el libro de Springer de 2000 de Pinheiro y Bates.
  • estructura de efectos fijos ( nlme ): nlme facilita (mucho) la inclusión de efectos fijos no triviales en el modelo. Como se ha documentado aquí es teóricamente posible pero bastante difícil incluir efectos fijos; esto se debe en gran parte a que las derivadas tienen que ser especificadas explícitamente para nlmer .
  • velocidad , capacidad para efectos aleatorios cruzados ( nlmer ): la maquinaria subyacente nlmer es más sofisticado/moderno que el de nlme lo que sugiere que debería ser más rápido y posiblemente más estable para problemas grandes.

¿Por qué no lo pruebas y lo ves?

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Gracias por sus comentarios. Efectivamente, estoy totalmente de acuerdo con tu comentario sobre la documentación. Yo elegí nlme inicialmente en parte por el libro de Bates. Hasta ahora, la modelización no lineal no está bien documentada en lme4; todavía estoy buscando recursos que me ayuden a entender la sintaxis, etc. Gracias también por los comentarios, creo que lo intentaré. Si conoces algún libro o documento sobre modelización no lineal en lme4, me interesaría mucho echarle un vistazo.

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