La respuesta a la pregunta de la primera frase es "sí". Dejemos que $M$ sea un manifold hiperbólico de 3 dimensiones cuyo grupo de isometría es trivial. Entonces, por el Teorema 1.1 de
Farb, Benson; Weinberger, Shmuel Hidden symmetries and arithmetic manifolds. Geometry, spectral theory, groups, and dynamics, 111-119, Contemp. Math., 387, Amer. Math. Soc., Providence, RI, 2005. (Revisor: Bachir Bekka) 53C35 (53C23)
(que atribuyen a Borel, aunque no dan una referencia original para ello), el grupo de isometría de toda métrica riemanniana sobre $M$ es isomorfo a un subgrupo del grupo de isometría hiperbólica, y por tanto es trivial.
En una línea similar, podría interesarle el Teorema H de
Dinkelbach, Jonathan y Leeb, Bernhard, Flujo de Ricci equivariante con cirugía y aplicaciones a las acciones de grupos finitos en 3manifolds geométricos. Geom. Topol. 13 (2009), no. 2, 1129-1173.
Dice que todo difeomorfismo de orden finito de una 3manifold hiperbólica cerrada es suavemente conjugado a una isometría, por lo que las 3manifolds hiperbólicas cerradas con grupos de isometría triviales dan ejemplos de variedades suaves con grupos de difeomorfismo sin torsión.
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Las variedades sin acciones efectivas de grupos de Lie se denominan asimétricas. Hay muchos ejemplos, véase kops.uni-konstanz.de/bitstream/handle/123456789/6288/ .