Como se mencionó en un comentario, hay gente como Colin McLarty que creo que podría dar una respuesta informada. Yo no soy una de esas personas, pero ya que esta pregunta es probable que ser cerrado de pronto, me limitaré a mencionar algunas referencias útiles.
Uno es McLarty el artículo de La Última Matemático de Hilbert Goettingen: Saunder Mac Lane como Filósofo de las Matemáticas. De hecho, los miembros de Bourbaki invitados Mac Lane para hablar con ellos, pero es probable que no Mac Lane francés que fue el problema en llegar a incorporar la categoría de la teoría a la gran visión. Mac Lane y Weil eran, por supuesto, sus colegas en la Universidad de Chicago y, presumiblemente, había una amplia oportunidad para discutir la categoría de teoría (en inglés), citado en McLarty del artículo, Weil escribe a sus compañeros de Bourbakiste Chevalley en 1951:
Como usted sabe, mi honorable colega Mac Lane mantiene toda noción de estructura necesariamente trae consigo una noción de homomorphism, que consta de indicar, para cada uno de los datos que componen la estructura, los que se comportan covariantly y que contravariantly [ ... ] ¿qué crees que podemos obtener de este tipo de consideración?
McLarty, explica en su artículo que Weil no entendía Mac Lane. Si entiendo correctamente, de hecho hubo oportunidades para incorporar la categoría de la teoría dentro de la Élements, específicamente como parte de una cuenta de un resumen de la teoría de estructuras, pero (McLarty, página 5):
Después de la guerra, Bourbaki muy debatido cómo hacer una teoría de trabajo. Todos estuvieron de acuerdo, se debe incluir morfismos. Los miembros de Cartier, Chevalley, Eilenberg, y Grothendieck defendido categorías, como lo hicieron sus visitantes Mac Lane. Pero Weil fue una mayoría de uno en el grupo, por lo que crearon una teoría de la estructura de la preservación de las funciones como morfismos (Bourbaki [1958]). Nunca usado, y no por falta de intentos.
A lo largo del debate de Bourbaki (o de Weil) la actitud hacia las categorías, McLarty menciona el trabajo de Leo Corry, quien discute Bourbaki las estructuras en su libro de Álgebra Moderna y el Surgimiento de Estructuras Matemáticas (reseñado aquí). Relacionado es un útil artículo en línea por Corry, publicado en Synthese, aquí. No voy a tratar de resumir, pero no hay discusión, sobre la base de los documentos, de "la interacción entre Bourbaki del trabajo y las primeras etapas de la categoría de la teoría".
Edit: Aunque el hilo se ha cerrado y quid (user9072) se ha apartado, Francois Ziegler recientemente traído a mi atención en un comentario más abajo que Ralf Krömer (2006; pdf) (subtitulada Bourbaki y categorías durante la década de 1950) ha investigado a fondo el OP pregunta, con inéditos interna informes de las reuniones de Bourbaki, así como de la correspondencia y de las comillas de, por ejemplo, Eilenberg (p. 142), Cartier (p. 147), Grothendieck (p. 149), y otros. Hay un rico tesoro de información procedente de allí, para aquellos que estén interesados.
