La razón principal para la notación es:
Debido a la inercia.
Una anotación, una vez establecida, tiende a permanecer igual. Esta es la notación de Gauss utiliza, por lo que es la notación que sus alumnos utilizan, y sus estudiantes, etc., etc. No todas las notaciones matemáticas están optimizados para mayor claridad. No me refiero a $\sin^n x$, y de cómo eso significa algo diferente si $n=-1$.
Dicho esto, la segunda parte de la respuesta es:
Ambas notaciones son utilizados, y se considera correcta.
Un montón de primaria de la teoría de números libros introducir la notación de subíndice como una alternativa. No se usa muy a menudo. Me parece que lo uso más en mi informales scratchwork, como un compromiso entre la completa, la notación habitual, y simplemente omitiendo el módulo.
Simplemente omitiendo el módulo también está permitida en los casos en que la ambigüedad no de resultado, pero casi nadie lo hace, al menos en el trabajo que van a mostrar a nadie. Por qué? Creo que, en última instancia:
Se ha convertido en parte de la cultura de la teoría de números.
La comprensión y el uso de un poco torpe notación ha convertido en parte de lo que significa llegar a conocer el tema, junto con el abandono de la ciencia de la computación (notación y de la concepción) de "$b \bmod C$" como un operador que toma un entero $b$ y devuelve el menos negativo de residuos modulo $C$. Es esta confusión? Sí, un poco. Es este un lema que establece el número teóricos aparte de los no iniciados? Sí, tipo de. Es útil, cuando la enseñanza de la materia, a veces el uso de la más natural de la notación de subíndice, y directamente a la dirección de la torpeza de los otros? Absolutamente.