Para polinomios sobre $\mathbb{R}$, la respuesta es no; por ejemplo, $f(x)=x$ y $g(x) = x(x^2+1)$ tienen las mismas raíces sobre $\mathbb{R}$—con las mismas multiplicidades—pero no son iguales.
Para polinomios sobre $\mathbb{C}$, la respuesta es casi. El teorema fundamental del álgebra establece que cada polinomio sobre $\mathbb{C}$ de grado $n \ge 1$ se factoriza de forma única en $n$ factores lineales. Por lo tanto, si $f$ y $g$ tienen las mismas raíces $\alpha_1,\alpha_2,\dots,\alpha_n$, enumeradas con multiplicidad, entonces $$ f(x) = \lambda (x-\alpha_1)\cdots(x-\alpha_n) \text{ y } g(x) = \mu(x-\alpha_1)\cdots(x-\alpha_n) $$ para algunos $0 \ne \lambda,\mu \in \mathbb{C}$. Por lo tanto, las raíces (con multiplicidad) determinan polinomios sobre $\mathbb{C}$ hasta una constante multiplicativa y, en particular, los polinomios mónicos sobre $\mathbb{C}$ están únicamente determinados por sus raíces.
Para polinomios sobre campos finitos, la respuesta es definitivamente no. Hay polinomios que no solo tienen las mismas raíces, sino que también tienen los mismos valores para cada entrada. Por ejemplo, los polinomios $f(x) = x$ y $g(x)=x^3$ sobre $\mathbb{F}_2$ cumplen $f(x)=g(x)$ para todos los $x \in \mathbb{F}_2$, y sin embargo $f \ne g$.
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Los polinomios $f(x)=1$, $g(x)=2$ y $h(x)=x^2+1$, $k(x)=x^2+x+1$ tienen las mismas raíces en $\Bbb R$.