¿Existe un software gratuito para calcular la carga neta de aminoácidos en función del pH?
Necesita Java. ¡Qué lástima! :(
¿Existe un software gratuito para calcular la carga neta de aminoácidos en función del pH?
Me gusta MarvinSketch. Puedes usarlo en tu navegador o en tu computadora. En Insertar > Plantilla, puedes encontrar todos los aminoácidos. Una vez que hayas insertado uno, selecciona Cálculos > Protonación > Punto isoeléctrico y haz clic en OK. Obtendrás una ventana que se ve así mostrando la carga neta versus pH (Elegí uno bastante aburrido, pero otros aminoácidos producen curvas más complejas):
Me encontré accidentalmente con esta antigua pregunta que no estaba completamente respondida. Recientemente escribí una aplicación web principalmente para el cálculo de propiedades fisicoquímicas de las proteínas (Prot pi). Pero también puedes utilizar esta herramienta para calcular/estimar la curva de titulación de aminoácidos individuales. Puedes ingresar el código de letra única para tu aminoácido (por ejemplo, k para la Lisina):
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