Lo hice por accidente hace unos meses, aunque fue con líneas y era una featureclass muy grande (creo que era del orden de 10 millones de features). Tampoco recuerdo si era SQL Server 2008 o 2012.
Una cosa que noté en ArcMap fue que todo era muy, muy lento. Hice un perfil. Encontré la consulta que estaba causando la lentitud y lo puso en SSMS y determinó que era el método de filtro que era el culpable (iirc, ArcMap utiliza filtro con un sobre para agarrar OIDs). ¡SQL Server estaba devolviendo cada una de las filas de la tabla!
Cuando cambié a geografía, Filter devolvía el número correcto de características para la geometría dada.
No recuerdo que otros métodos se comporten mal, pero no dejé los datos de 4326 en geometría SQL el tiempo suficiente para averiguarlo.
Si el tamaño de su mesa no es muy grande, esto podría no importar. Pero es algo a tener en cuenta para las tablas más grandes. Tampoco importaría si QGIS no utiliza Filter
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