¿Importa la ubicación de las anotaciones línea-borde-borde?

Question

En la notación línea-borde-borde, al ilustrar que un átomo o enlace se dirige hacia el espectador o se aleja de él (triángulo sólido para ir hacia delante, líneas de puntos para ir hacia atrás), ¿importa la ubicación de estas líneas al hacer las ilustraciones?

Por ejemplo, una molécula de THC.

Los dos átomos de hidrógeno allí. ¿Podrían colocarse dentro de los anillos de carbono en lugar de aparecer fuera, como abajo?

Entiendo que hay un montón de problemas con eso de otra manera, pero sólo preguntaba por el triángulo y los guiones en particular.

Answer 1

Sí, tanto las colocaciones interiores como las exteriores son posibles con algunos matices.

En Representación gráfica de la configuración estereoquímica (Recomendaciones de la IUPAC 2006) [ 1 , p. 1926]:

ST-1.3.2: Centros estereogénicos en átomos de fusión de anillos

Los centros estereogénicos en los átomos de fusión del anillo deben dibujarse con enlaces en cuña o en cuña sólida con el sustituyente exocíclico en el átomo de fusión siempre que sea posible. Si es necesario, debe explicitarse un hidrógeno implícito para proporcionar un sustituyente excíclico que soporte el enlace en cuña o en cuña sólida. Cuando uno de los enlaces de fusión está orientado verticalmente y el sustituyente excíclico es gráficamente pequeño (como un hidrógeno o un grupo metilo, o incluso sustituyentes físicamente más grandes como un grupo fenilo representado con una etiqueta de grupo "Ph" gráficamente pequeña), el sustituyente excíclico también es orientado preferentemente en sentido vertical y opuesto al enlace de fusión vertical. Esta orientación se prefiere incluso si el resultado es que el sustituyente se sitúa dentro del sistema de anillos, y es particularmente común en la representación de esteroides y otros productos naturales.

En Normas de representación gráfica de los diagramas de estructura química (Recomendaciones IUPAC 2008) [ 2 , p. 354-357]:

GR-4.2.2 Átomos de fusión con un sustituyente dibujado

Los átomos de fusión anular ya tienen tres enlaces dentro del sistema anular. En el caso de los átomos de fusión anular externa, el sustituyente debe situarse preferentemente fuera del sistema anular y orientarse de modo que bisecte el ángulo entre los enlaces adyacentes.

[...]

Cuando dos átomos de fusión sustituidos son adyacentes, colocar ambos sustituyentes fuera del sistema de anillos hará que normalmente se solapen. En esos casos, es mejor dibujar uno de los sustituyentes dentro del sistema de anillos. Un sustituyente dibujado de este modo debe dibujarse preferentemente en sentido vertical u horizontal, según la dirección que minimice el solapamiento con otros átomos y enlaces.

Si un átomo de fusión sustituido es adyacente a un átomo de fusión no sustituido, normalmente hay espacio suficiente para orientar el sustituyente dentro o fuera del sistema de anillos. Dicho sustituyente debe orientarse fuera del sistema de anillos si todos los sustituyentes pueden orientarse hacia fuera, pero preferiblemente debe trazarse exactamente en vertical u horizontal si cualquier otro sustituyente se coloca dentro del sistema de anillos para evitar conflicto con un sustituyente adyacente.

Los sustituyentes pequeños en los átomos C-8 y C-9 de los esteroides deben dibujarse dentro del sistema de anillos de esta manera, incluso si no hay sustituyentes en los átomos de fusión adyacentes C-10 y C-14. Algunos otros productos naturales [23] también tienen orientaciones preferidas que sitúan a los sustituyentes dentro del sistema de anillos.

Un sustituyente no debe orientarse dentro de un sistema de anillos cuando se une a un átomo de fusión que carece de cualquier enlace de fusión vertical u horizontal. El sustituyente debe orientarse fuera del sistema de anillos, minimizando el solapamiento tanto como sea posible. A veces, puede ser posible reorientar el sistema de anillos para que los enlaces de fusión sean verticales; si es así, los sustituyentes deben colocarse verticalmente.

No es aceptable orientar dos sustituyentes dentro del mismo anillo si éste tiene menos de ocho átomos. Uno o ambos sustituyentes deben orientarse fuera del sistema de anillos, minimizando el solapamiento lo mejor posible.

Los sustituyentes en los átomos de fusión interiores no tienen otra opción que ser atraídos dentro del sistema de anillos. Como en el caso anterior, estos sustituyentes deben dibujarse preferentemente en sentido vertical u horizontal, según la dirección que minimice el solapamiento con otros átomos y enlaces.

Referencias

1. Brecher, J. Representación gráfica de la configuración estereoquímica (Recomendaciones de la IUPAC 2006). Química pura y aplicada 2009 , 78 (10), 1897-1970. https://doi.org/10.1351/pac200678101897 . (Acceso gratuito)
2. Brecher, J. Graphical Representation Standards for Chemical Structure Diagrams (Recomendaciones de la IUPAC 2008). Química pura y aplicada 2009 , 80 (2), 277-410. https://doi.org/10.1351/pac200880020277 . (Acceso gratuito)