De la página 327 de Guía del usuario de ChemDraw 18 :
Importación de
Puede importar gráficos o documentos de otras aplicaciones a ChemDraw.
Archivos
Los archivos que insertas pasan a formar parte del dibujo. Sólo puede editar un archivo si está en formato ChemDraw.
Para insertar un archivo:
- Navegue hasta Editar → Insertar archivo .
- En el cuadro de diálogo Abrir, seleccione el tipo de archivo en la lista desplegable.
- Seleccione el archivo y haga clic en Abrir . El archivo está incrustado en el dibujo.
Además, hay una tabla de formatos de archivo que ChemDraw es capaz de importar y exportar, de la que se desprende que sólo los siguientes formatos gráficos pueden ser importado :
- Mapa de bits (BMP)
- Formato de imagen gráfica (GIF)
- JPEG (JPG, JPEG)
- Gráficos de red portátiles (PNG)
- Metafichas de Windows (EMF, WMF)
- Archivo de imagen etiquetado (TIF, TIFF)
Los archivos PDF o PostScript se pueden adjuntar como objetos, pero supongo que no es lo que buscas. En cualquier caso, parece que no hay manera de añadir archivos AI directamente, por lo que necesitan convertirlos primero a formato rasterizado (por ejemplo, TIFF o PNG) o vectorial (WMF). Estoy de acuerdo con @Ivan en que elaborar las estructuras en ChemDraw en primer lugar y después procesarlas con Adobe Illustrator es posiblemente un mejor flujo de trabajo.
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Lo dudo. Es mejor mantener la parte química en ChemDraw y pegar desde ella cuando esté listo.
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Voto por cerrar esta pregunta como off-topic porque es un tema de software.