Si se trata de un simple motor de corriente continua con solo dos conexiones, entonces sí, puedes conectar un cable a la alimentación y utilizar un elemento de conmutación del lado bajo en el otro. No olvides colocar un diodo Schottky inverso a través del motor, de lo contrario el interruptor se dañará por los pulsos de alta tensión.
Con solo 12 V, puedes encontrar FET de canal N que se pueden conmutar lo suficientemente bien directamente desde una señal digital. A menudo se les llama FET "de nivel lógico". En ese caso, no necesitas un controlador de FET.
Otra posibilidad es un NPN como interruptor. Es fácil de controlar desde lógica de bajo voltaje, pero apagar un bipolar saturado siempre es un poco complicado. Depende de qué tan rápido quieras ir. Para una frecuencia de PWM de accionamiento de motor normal de aproximadamente 25 kHz, debería estar bien. Sin embargo, a menos que estés utilizando niveles lógicos inusualmente bajos o el microcontrolador tenga una salida de accionamiento débil, yo miraría primero los FET de canal N de nivel lógico.