Creo que una de las principales desventajas de tu circuito es que el Vin+ está conectado a tierra, es decir, a la barra de alimentación negativa, y esto hará que tu salida entre en saturación porque Vin- está a varios voltios de diferencia. También me preocupa un poco que, como el dispositivo no está conectado a un raíl, se produzcan situaciones extrañas en las que la salida se invierta porque se supere el rango de modo común en las entradas.
Estoy pensando en lo que se llama como un cortador de datos. Este circuito tenderá a mantener Vin+ y Vin- más cerca el uno del otro. He aquí una idea a medias de un circuito del que haré algunas puntualizaciones por debajo
Asumiendo que la entrada de luz a la LDR es constante, los voltajes en Vin+ y Vin- serán, aparte del ruido, muy cercanos. En efecto, la salida será un amplificador de ruido, pero en presencia de una pequeña señal de datos, la salida amplificará y reproducirá los datos como señales de nivel CMOS - este es su principal uso.
Como no estás usando datos y tampoco quieres una salida con mucho ruido, puedes poner una resistencia a través del condensador para que la entrada a Vin+ sea ligeramente menor que Vin-. Tal vez intente 1Mohm. Esto separará las entradas lo suficiente como para evitar que el ruido se cuele y también te dará un valor de control para optimizar la respuesta que necesitas. Yo probaría con un pote de 1Mohm (en serie con 100k) a través de la tapa y haría algunas pruebas.
La salida será un pulso decente porque el op-amp está siendo utilizado como un comparador. NB Sé que este dispositivo funciona bastante bien así.