Esto es para identificar qué pin es el "pin 1".
En el caso de una cabecera de una sola fila sin clave de orientación, esto podría no importar realmente, pero la herramienta de diseño podría hacer esto por defecto y el diseñador no pensó en desactivarlo.
Si esto se utilizara con un conector que sí tiene una tecla de orientación, preferiría tener también un indicador del pin 1 en serigrafía, para poder comprobar la orientación después de cargar el conector (y sin tener que dar la vuelta a la placa).
¿Se pueden empujar más amperios a través de la almohadilla cuadrada que de la redonda?
No, no causará ninguna diferencia significativa en el rendimiento del circuito.
(Como se ha señalado en los comentarios, para una aplicación de radiofrecuencia o de alta tensión podría ser necesario considerar más cuidadosamente antes de utilizar este método de marcado de orientación)