Cualquier sistema coherente va a hacer. Ese es todo el punto de los sistemas de unidades-si usted se pega a uno, usted no necesita preocuparse acerca de las unidades demasiado. Y no ocurre que una determinada ecuación sólo funciona en un determinado sistema*.
En este caso, se utilizaría julios ($\:\mathrm{J}\equiv\:\mathrm{kg\:m^2\:s^{-2}}$), la unidad de medida de energía. Si usted está usando el sistema cgs, $m$ sería en gramos, $p$ estaría en $\:\mathrm{g\:cm\:s^{-1}}$, $c$ sería en centímetros por segundo, y $E$ sería en ergios ($\:\mathrm{erg}\cong\:\mathrm{g\:cm^2\:s^{-2}}$),
Constantes físicas pueden cambiar. También, algunas de las ecuaciones que tienen algunas constantes conjunto a uno (por ejemplo, unidades de Planck, Gauss unidades), por lo que puede desaparecer completamente. Por ejemplo, si $c=1$ (unidades de Planck), la ecuación se convierte en $E^2=m^2+p^2$.