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¿Cómo conectar las proteínas mediante enlaces disulfuro computacionalmente?

Quiero conectar a las proteínas para formar un dímero. Como se ve en la imagen, los monómeros se acercan el uno al otro a lo largo del borde de la estructura de orden superior (olvidarse de que el sulfato de allí). ¿Cómo puedo averiguar, donde tengo que introducir un Xaa->Cys mutación, de modo que el más estable de los puentes disulfuro se forma entre las proteínas? Es fácil obtener una pista visual en la que la mutación puede ser bueno, pero es un buen método de cálculo para calcular las energías y escanear a través de algunas de las posibilidades?

(También me gustaría ir con hidrofóbicos o van de Waals interacciones. Básicamente, yo solo quiero pegar en la que esas proteínas juntos).

Edge of two proteins (modelled in Chimera)

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Ben Puntos 266

Si tiene un modelo estructural para la interacción, es decir, coordenadas atómicas, puede utilizar nuestro software llamado Disulfide by Design. Vea los siguientes enlaces.

http://cptweb.cpt.wayne.edu/DbD2/

http://www.biomedcentral.com/1471-2105/14/346

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