Denotamos $f(n):=\sum_{d|n}f_k(d)\mu\left(\frac{n}{d}\right)$. Para $\gcd(n,m)=1$ hemos
\begin{align}
f(n)f(m)
&=\sum_{d|n}f_k(d)\mu\left(\frac{n}{d}\right)\sum_{e|m}f_k(e)\mu\left(\frac{m}{e}\right)
\\&=\sum_{d|n}\sum_{e|m}f_k(d)f_k(e)\mu\left(\frac{n}{d}\right)\mu\left(\frac{m}{e}\right)
\\&=\sum_{d|n}\sum_{e|m}f_k(de)\mu\left(\frac{n}{d}\frac{m}{e}\right)
\\&=\sum_{d|nm}f_k(d)\mu\left(\frac{nm}{d}\right)
\\&=f(nm).
\end{align}
Para el prime $p$ tal que $p^n\nmid k$ tenemos $f_k(p^n)=f_k(p^{n-1})$, por lo que
\begin{align}
f(p^n)
&=\sum_{d|p^n}f_k(d)\mu\left(\frac{p^n}{d}\right)
\\&=\sum_{i=0}^nf_k(p^i)\mu(p^{n-i})
\\&=f_k(p^{n-1})\mu(p)+f_k(p^n)\mu(1)
\\&=0.
\end{align}
Aquí se puede olvidarse de $i<n-1$ porque $\mu(p^{n-i})=0$. La última igualdad se sigue de $\mu(p)=-1$ e $\mu(1)=1$.
Para todos los $n>k$ existe un primo que divide a $n$ más veces de las $k$, por lo que las dos propiedades que acaba de probar, nos encontramos con $f(n)=0$.