La respuesta de Ted ya describió lo que haría, pero dejó muchas cosas para que los lectores las resuelvan o las busquen. Así que aquí daré detalles sobre esto. La idea principal es transformar el problema a un círculo, donde las áreas se calculan más fácilmente.
Transformando coordenadas
La parametrización polar de una elipse (alineada con el eje) desde su foco está dada por
$$\overline{FP}=r(\theta)=\frac{a(1-e^2)}{1+e\cos\theta}$$
donde $a$ es el semieje mayor, $e$ es la excentricidad y $\theta$ es el ángulo, es decir, la anomalía verdadera. Expresado en coordenadas, esto es
$$\overrightarrow{FP}= \begin{pmatrix}r(\theta)\cos\theta\\r(\theta)\sin\theta\end{pmatrix}$$
Ahora estira todo en dirección de su semieje menor (es decir, en su dirección $y$) por un factor de
$$\frac ab=\frac1{\sqrt{1-e^2}}$$
El resultado será un círculo de radio $a$. El origen sigue siendo el punto que solía ser el foco. La distancia entre ese punto y el centro es $\overline{CF}=ae$ (también llamada excéntricidad lineal o distancia focal). Así que agrega eso a las coordenadas $x$ para mover el origen al centro. Juntos ahora tienes
$$ \overrightarrow{CQ}= \begin{pmatrix}r(\theta)\cos\theta+ae\\ \frac ab r(\theta)\sin\theta\end{pmatrix} = \frac{a}{1+e\cos\theta} \begin{pmatrix}(1-e^2)\cos\theta+e+e^2\cos\theta\\ \sqrt{1-e^2}\sin\theta\end{pmatrix} $$
Anomalía excéntrica
El ángulo para ese punto (contra el eje horizontal) es la anomalía excéntrica $E$, por lo que cumple con la siguiente relación:
$$\tan E=\frac{\sqrt{1-e^2}\sin\theta} {(1-e^2)\cos\theta+e+e^2\cos\theta}$$
Usando la substitución de tangente de medio ángulo que André mencionó en su respuesta, puedes convertir esto en
\begin{align*} \frac{2\tan\frac E2}{1-\tan^2\frac E2}&= \frac{\sqrt{1-e^2}2\tan\frac\theta2} {(1-e^2)(1-\tan^2\frac\theta2)+e(1+\tan^2\frac\theta2)+e^2(1-\tan^2\frac\theta2)} \\&= \frac{2\sqrt{(1+e)(1-e)}\tan\frac\theta2}{(1+e)-(1-e)\tan^2\frac\theta2} =\frac{2\sqrt{\frac{1-e}{1+e}}\tan\frac\theta2} {1-\frac{1-e}{1+e}\tan^2\frac\theta2} \end{align*}
Simplemente comparando ambos lados puedes ver
$$\tan\frac E2 = \sqrt{\frac{1-e}{1+e}}\tan\frac\theta2$$
Esto concuerda con la relación que Wikipedia menciona. Y tratar con la tangente de la mitad del ángulo tiene el beneficio de que puedes calcular la arcotangente sin preocuparte por el cuadrante. Simplemente puedes calcular
$$E=2\arctan\left(\sqrt{\frac{1-e}{1+e}}\tan\frac\theta2\right)$$
excepto en el caso especial cuando $\theta=\pm\pi$ lo cual resulta en una tangente infinita pero también en $E=\pm\pi$.
Área del sector circular
Ahora sabes que el área de un sector circular es proporcional al ángulo, así que para un círculo de radio $a$ esto sería $\frac12a^2E$. Esa es la suma de las áreas amarilla y cian, es decir, el sector $ACQ$.
Desde el centro de regreso al foco
Pero esa área está subtendida por el centro, no por el foco. Por lo tanto, resta un triángulo de base $ae$ y altura $a\sin E$ (el triángulo cian $\triangle FCQ$) y obtendrás el área subtendida por el foco ($AFQ$ coloreada de amarillo):
$$ \tfrac12a^2E-\tfrac12a^2e\sin E=\tfrac12a^2\left(E - e\sin E\right) $$
De regreso a la elipse
Esto aún es un área en el círculo. Para regresar a la elipse original, debes deshacer el escalado, es decir, escalar la dirección $y$ por $\frac ba$. Esto escala las áreas por el mismo factor. Así que el área por la que estabas preguntando ($AFP$ teñida de rojo) sería
$$\tfrac12ab\left(E-e\sin E\right)$$
Anomalía media
A medida que varías $\theta$ de $0$ a $2\pi$, el área anterior variará de $0$ a $ab\pi$. Dado que áreas iguales se barrerán en tiempos iguales, esto está estrechamente relacionado con la anomalía media que barre de $0$ a $2\pi$ en un tiempo constante.
$$M=E-e\sin E$$
Este resultado nuevamente es mencionado en Wikipedia, con una referencia a la ecuación de Kepler. Entonces en términos de la anomalía media, obtendrías el área como
$$\tfrac12abM$$
tal como ben escribió en este comentario.
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¿Has intentado mirar la fórmula de coordenadas polares para la elipse con el origen en un foco?
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Oh, ¿entonces integro eso sobre el sector?
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Area Ellipse web.tiscali.it/vaglieco www.geometriaparametrica (Chapter VII Ellipse Area and Perimeter) Graphic Example: www.geogebratube.org/student/m66410 Área Elipse web.tiscali.it/vaglieco www.geometriaparametrica (Capítulo VII Área y Perímetro de la Elipse) Ejemplo Gráfico: www.geogebratube.org/student/m66410