La siguiente es mi mejor conjetura, después de leer el libro.
La relación de covarianza factor, $\Lambda_\theta$ $q \times q$ matriz (dimensiones se explican en el extracto que has publicado).
Para un modelo con un simple escalar de efectos aleatorios plazo, (p. 15, Fig. 1.3) se calcula como un múltiplo de $\theta$ y la matriz identidad de dimensiones $q \times q$:
$$\Lambda_\theta = \theta \times {I_q}$$
This is the general way to calculate $\Lambda_\theta$, and it is modified according to the number of random-effects and their covariance structure. For a model with two uncorrelated random-effects terms in a crossed design, as on pp. 32-34, it is block diagonal with two blocks each of which is a multiple of $\theta$ and identity (p. 34, Fig. 2.4):
Same with two nested random-effects terms (p. 43, Fig. 2.10, not shown here).
For a longitudinal (repeated-measures) model with a random intercept and a random slope which are allowed to correlate $\Lambda_\theta$ consists of triangular blocks representing both random-effects and their correlation (p. 62, Fig. 3.2):
Modelling the same dataset with two uncorrelated random-effects terms (p. 65, Fig. 3.3) returns $\Lambda_\theta$ of the same structure as shown previously, in Fig. 2.4:
Additional notes:
The variance-component parameter vector $\theta$ is estimated iteratively to minimise the model deviance $\widetilde{d}$ according to eq. 1.10 (p. 14).
$\theta_i = \frac{\sigma_i}{\sigma}$
Donde $\sigma_i$ se refiere a la raíz cuadrada de la i-ésima de efectos aleatorios varianza, y $\sigma$ se refiere a la raíz cuadrada de la varianza residual (compare con las páginas 32-34).
La versión del libro de 25 de junio de 2010, se refiere a una versión de lme4
el cual ha sido modificado. Una de las consecuencias es que en la versión actual 1.1.-10. el modelo de efectos aleatorios clase de objeto merMod
tiene una estructura diferente y $\Lambda_\theta$ se accede de una manera diferente, utilizando el método getME
:
image(getME(fm01ML, "Lambda"))