Esto es cierto independientemente de si $x \in FV(MN)$.
Prueba. Por hipótesis:
$$Mx =_{\beta\eta} Nx \tag{1}$$
Luego también:
$$(\lambda x.Mx) =_{\beta\eta} (\lambda x.Nx) \tag{2}$$
La justificación de la $(2)$ es que la secuencia de (posiblemente revertir parcialmente) $\beta\eta$-contracciones que demuestre $(1)$ también resultará $(2)$ cuando se aplica a la subterm $Mx$$(\lambda x.Mx)$.
Por otro lado, en la teoría formal de $\lambda\beta\eta$ (y también a $\lambda\beta$) este hecho se explica por la debilidad de extensionality' regla de inferencia $\xi$:
\begin{align}
M &\;= M' \\
\hline
(\lambda x.M) &\;= (\lambda x.M')
\tag{%#%#%}
\end{align}
Desde
$\xi$$
usted podría, en principio, sólo citar regla de $$ \lambda\beta\eta \vdash M = N \iff M =_{\beta\eta} N$ a deducir $\xi$$(2)$.
Además, por la $(1)$-regla:
$\eta$$
$$(\lambda x.Mx) =_{\beta\eta} M \tag{3}$$
Así que por $$(\lambda x.Nx) =_{\beta\eta} N \tag{4}$, $(2)$, $(3)$ y la simetría y la transitividad de la $(4)$ tenemos:
$=_{\beta\eta}$$
lo que concluye la prueba. $$M =_{\beta\eta} (\lambda x.Mx) =_{\beta\eta} (\lambda x.Nx) =_{\beta\eta} N$
Tenga en cuenta que el $\square$-la regla general es añadido a un $\eta$-de la teoría a hacer extensional (en lugar de intensional), así que la verdad de su declaración de que estaba a la espera.