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¿Cuáles son las definiciones de la frontera en el diagrama de Ramachandran?

He escuchado a algunas personas se menciona que tal o cual programa no está "al día" con respecto a las fronteras en el Ramachandran parcelas para clasificar φ/ψ como en las regiones más favorables/aceptable/no permitido.

¿Cómo son definidas las regiones aceptadas? ¿Cuál es el papel aceptado actual que cubre esto?

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lubos hasko Puntos 13669

Me gustaría poder responder a su pregunta directamente, pero esto está fuera de mi área de especialización. Lo mejor que puedo darte es un lugar para empezar. Espero que algún libro reciente sobre la proteómica iba a cubrir este tema. Por ejemplo, Introducción a la Proteómica: Principios y Aplicaciones (Métodos de Análisis Bioquímico) por Mishra y Blobel, Wiley, 2010.

He encontrado algunos prometedores papeles con un poco de búsqueda con SciFinder. Ni yo ni mi institución suscribirse a la Proteína de la Ciencia, pero el resumen se ve prometedor. He desnatada en el artículo en PNAS. Espero que uno de estos artículos tiene su respuesta.

Zhou, et al, "Revisando el Ramachandran de la trama desde un nuevo ángulo", la Ciencia de las Proteínas de 2011 1166-1171.

Porter y la Rosa, "de volver a dibujar el Ramachandran de la parcela después de la inclusión de enlaces de hidrógeno en las limitaciones", PNAS, *2011, 108, 1, 109-112

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