Ah, qué error tan complicado has cometido. El problema es que simplemente has confundido algunas nociones en cálculo multivariable. Sin embargo, no te sientas mal: esto generalmente está muy mal explicado. Ambos pasos 1 y 3 arriba son incorrectos. Tenga la seguridad, la ecuación de Euler-Lagrange no es trivial.
Primero demos un paso atrás. El Lagrangiano para una partícula moviéndose en una dimensión en una energía potencial externa $V(q)$ es $$ L(q, \dot q) = \frac{1}{2}m \dot q^2 - V(q). $$ Así es como la mayoría de las personas lo escriben. Sin embargo, esto es muy confuso, porque claramente $q$ y $\dot q$ no son variables independientes. Una vez que $q$ está especificado en todos los tiempos, $\dot q$ también está especificado en todos los tiempos.
Una forma mejor de escribir el Lagrangiano anterior podría ser $$ L(a, b) = \frac{1}{2}m b^2 - V(a). $$ Aquí hemos expuesto el Lagrangiano por lo que realmente es: una función que toma dos números y produce un número real. Asimismo, podemos ver claramente que $$ \frac{\partial L}{\partial a} = -V'(a) \hspace{1cm} \frac{\partial L}{\partial b} = m b. $$ Por lo general, la mayoría de las personas escriben esto como $$ \frac{\partial L}{\partial q} = -V'(q) \hspace{1cm} \frac{\partial L}{\partial \dot q} = m \dot q. $$ Sin embargo, $q$ y $\dot q$ deben entenderse como variables independientes para hacer esto correctamente. Así como $a$ y $b$ eran variables independientes, $q$ y $\dot q$ también lo son cuando se ponen en el Lagrangiano. En otras palabras, podríamos poner cualquier par de números en $L$; simplemente decidimos poner $q$ y $\dot q.
Además, analicemos la derivada total con respecto al tiempo $\frac{d}{dt}$. ¿Cómo debemos entender la siguiente expresión? $$ \frac{d}{dt} L(q(t), \dot q(t)) $$ Tanto $q$ como $\dot q$ son funciones del tiempo. Por lo tanto, $L(q(t), \dot q(t))$ depende del tiempo simplemente porque $q(t)$ y $\dot q(t)$ lo hacen. Por lo tanto, para evaluar la expresión anterior, necesitamos usar la regla de la cadena en cálculo multivariable. $$ \frac{d}{dt} L(q(t), \dot q(t)) = \frac{dq}{dt} \frac{\partial L}{\partial a}(q(t), \dot q(t)) + \frac{d \dot q}{dt} \frac{\partial L}{\partial b}(q(t), \dot q(t)) = \dot q(t) \frac{\partial L}{\partial a}(q(t), \dot q(t)) + \ddot q(t) \frac{\partial L}{\partial b}(q(t), \dot q(t)) $$
En la expresión anterior, una vez más utilicé $a$ y $b$ para hacer mi punto más claro. Debemos tomar derivadas parciales de $L$ asumiendo que $a$ y $b$ son variables independientes. DESPUÉS de diferenciar, LUEGO evaluamos $\partial L / \partial a$ y $\partial L / \partial b$ al sustituir $(q, \dot q)$ en los espacios de $(a, b)$. Esto es similar a la forma en que en cálculo de una sola variable, si tienes $$ f(x) = x^2 $$ y deseas encontrar $f'(3)$, primero diferencias $f(x)$ manteniendo $x$ como una variable no especificada, y LUEGO sustituyes $x = 3$.
En tu primer paso, las derivadas NO conmutan porque $t$ y $q$ no son independientes. ($q$ depende de $t$). Sí, las derivadas parciales conmutan, pero SOLAMENTE si las variables son independientes. En tu tercer paso, no puedes "cancelar los puntos" porque $L$ depende de dos entradas. Si $L$ solo dependiera de $q$, entonces sí, podrías "cancelar los puntos" (ya que esto es equivalente a la regla de la cadena en cálculo de una sola variable), pero no lo hace, por lo que no puedes.
EDICIÓN: Puedes ver por ti mismo que la ecuación de Euler-Lagrange no es idénticamente $0$. Si tomas el Lagrangiano $L(q, \dot q)$ que he escrito arriba y lo sustituyes en la ecuación de Euler-Lagrange, obtienes $$ m \ddot q(t) + V'(q(t)) = 0. $$ Esto no es lo mismo que $0 = 0$. Es una condición que una trayectoria $q(t)$ debería satisfacer para extremizar la acción. Si fuera $0 = 0$, entonces todas las trayectorias extremizarían la acción.
EDICIÓN: Como señala Arthur, este es también un buen momento para discutir la diferencia entre $dL / dt$ y $\partial L / \partial t$. Si tenemos un Lagrangiano dependiente del tiempo, $$ L(q, \dot q, t) $$ entonces $L$ puede depender explícitamente de $t$, en lugar de simplemente a través de $q$ y $\dot q. Entonces, por ejemplo, mientras que podríamos tener el Lagrangiano para una partícula en un campo gravitacional constante $g$ como $$ L(a,b) = \frac{1}{2} mb^2 - m g a $$ si permitimos que $L$ dependa explícitamente de $t$, podríamos tener el campo gravitacional volverse más fuerte con el tiempo: $$ L(a,b,t) = \frac{1}{2} mb^2 - m ( C t )a. $$ ($C$ es una constante tal que $Ct$ tiene las mismas unidades que $g$.)
La cantidad $$ \frac{\partial}{\partial t} L(a, b, t) $$ debe entenderse como la diferenciación de la "ranura t" de $L. En el ejemplo anterior, tendríamos $$ \frac{\partial}{\partial t} L(a,b,t) = - m C a. $$ La cantidad $$ \frac{d}{d t} L(q(t), \dot q(t), t) $$ debe entenderse como la derivada de tiempo completo de $L$ debido al hecho de que $q$ y $\dot q$ también dependen de $t. Para el ejemplo anterior, \begin{align*} \frac{d}{d t} L(q(t), \dot q(t), t) &= \dot q(t) \frac{\partial L}{\partial a}(q(t), \dot q(t),t) + \ddot q(t) \frac{\partial L}{\partial b}(q(t), \dot q(t),t) + \frac{\partial L}{\partial t} (q(t), \dot q(t), t) \\ &= (\dot q) (-mC t ) + \ddot q(t) (m \dot q(t)) - mC q(t) \end{align*}
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Puedes requerir la ecuación EL para cualquier funcional. Sin embargo, tu tesis de que es una identidad general es incorrecta. ¿Dónde obtuviste las ideas para el paso 1 y 3?
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En realidad, para derivar las ecuaciones EL se involucra uno de los principios más importantes de la física, conocido como Principio Variacional o Principio de Hamilton. Este principio, del cual se derivan las ecuaciones EL, establece que la trayectoria que seguirá el objeto, si se le permite moverse libremente, es aquella que hace que la variación de la acción $S$ se anule. En fórmula, $\delta S = 0$