Actualmente estoy trabajando en la construcción de mi propio y sencillo lector RFID. Ya he construido un pequeño circuito en el que mi bobina se alimenta de una fuente de corriente de 5V o se conecta a tierra dependiendo de la señal de onda cuadrada de 125kHz del microcontrolador.
He medido la frecuencia de la señal entre la bobina y el condensador C1 - es exactamente 125kHz. D1, C2, R3 son una especie de demodulador AM.
Lo que quería conseguir tras acercar el transpondedor a la bobina era un cambio en la amplitud, pero no de toda la señal, sólo en algunos de los picos. Lo que conseguí es que toda la amplitud de la señal disminuyera unos 2V.
¿Puede alguien decirme qué es lo que falla en mi configuración? Adjunto mi esquema y las mediciones de un osciloscopio entre L1 y C1 (amarillo) y después de D1 (azul).
Gracias. 
ACTUALIZACIÓN (20140323):
La misma señal, pero he ampliado en el dominio del tiempo (sin transpondedor): 
La misma señal, pero he ampliado en el dominio del tiempo (con transpondedor): 
Si ampliamos la señal después del diodo, con el transpondedor cerca de la bobina, podemos ver algo así (con y sin filtro de paso bajo de software):
La misma señal sin un transpondedor cerca de la bobina: 
