Una cosa importante es que mientras se hace u-sustitución, la sustitución ha de ser inyectiva. Cuando se sustituye $u=\tan x$ en samjoe la respuesta, $\tan x$ no es inyectiva en toda la recta real, pero es inyectiva en intervalos de longitud de $\pi$. Es por eso que usted obtenga el derecho 'comportamiento' sólo dentro de intervalos, pero no entre ellos.
Yo creo que el Geogebra la respuesta puede ser derivada al señalar que
$$\frac1{\pi}(arctan(\cot(\pi x))+\pi x-\pi/2)$$ se comporta exactamente de la misma como una función del suelo.
Utilizar también la suma fórmula para arctan:
$$arctan (u)+arctan (v)=arctan(\frac{u+v}{1-uv})$$
AÑADIÓ:
Para demostrar la importancia de la inyectividad de sustituciones, considere la integral
$$\int^1_{0}xdx$$ which equals $\frac12$.
Si sustituimos en $u=x^2-x$, obtenemos algo como
$$\int^0_0 \cdots du=0$$
¿Qué causó la paradoja es $x^2-x$ no es inyectiva en el intervalo de $[0,1]$.
Del mismo modo, no hay nada de malo para
$$\int^x_k \frac1{1+\cos ^2x}dx=\int^x_k\frac{\sec^2x}{2+\tan^2x}dx=^{u=\tan x}\int^{arctan(x)}_{arctan(k)}\frac{du}{2+u^2}=\frac1{\sqrt2}arctan(\frac{\tan x}{\sqrt2})+C$$ as long as $\tan x$ is injective in the interval $[k,x]$. If the injectivity is not achieved in the interval, $C$ would change when $x$ goes from an injective interval of $\tan x$ a otro.
Esto concuerda con lo que el OP se observa: la función del suelo, es una cosa constante en cada inyectiva intervalo de $\tan x$, y los cambios cuando se va a través de los intervalos. Se puede considerar, la función del suelo cosa es parte de $C$.
La elección de $k$ es arbitrario. Pero cuando tratamos de encontrar una antiderivada para todos los $x$ mientras $k$ permanece fija, es imposible para lograr siempre la inyectividad en $[k,x]$. Como un trade-off, tenemos que añadir una función del suelo para compensar el silencio de cambio de $C$.
AÑADIDO 2:
@samjoe derivados de la antiderivada $$\frac{\pi}{\sqrt2}\left \lfloor\frac{x+\pi/2}{\pi}\right\rfloor + \frac{1}{\sqrt 2}\arctan\left(\frac{\tan x}{\sqrt2}\right) $$
Observando $$\lfloor x\rfloor=\frac1{\pi}(arctan(\cot(\pi x))+\pi x-\pi/2)$$, la expresión anterior puede ser reescrito para
$$\frac{x}{\sqrt2}+\frac{arctan(-\tan x)}{\sqrt2}+\frac{arctan(\frac{\tan x}{\sqrt2})}{\sqrt2}$$
$$=\frac{x}{\sqrt2}+\frac1{\sqrt2}({arctan(-\tan x)}+arctan(\frac{\tan x}{\sqrt2}))$$
Por la suma de la fórmula indicada anteriormente
$$=\frac{x}{\sqrt2}+\frac1{\sqrt2}arctan(\frac{-\tan x+\frac{\tan x}{\sqrt2}}{1+\frac{\tan^2x}{\sqrt2}})$$
$$=\frac{x}{\sqrt2}+\frac1{\sqrt2}arctan(\frac{\tan x(1-\sqrt2)}{\sqrt2+\tan^2x+1-1})$$
$$=\frac{x}{\sqrt2}+\frac1{\sqrt2}arctan(\frac{\tan x(1-\sqrt2)}{\sqrt2+\sec^2x-1})$$
$$=\frac{x}{\sqrt2}+\frac1{\sqrt2}arctan(\frac{(1-\sqrt2)\sin x\cos x}{(\sqrt2-1)\cos^2 x+1})$$
$$=\frac{x}{\sqrt2}+\frac1{\sqrt2}arctan(\frac{(1-\sqrt2)2\sin x\cos x}{(\sqrt2-1)(2\cos^2 x)+2})$$
$$=\frac{x}{\sqrt2}+\frac1{\sqrt2}arctan(\frac{(1-\sqrt2)\sin 2x}{(\sqrt2-1)(\cos 2x +1)+2})$$
$$=\frac{x}{\sqrt2}+\frac1{\sqrt2}arctan(\frac{(1-\sqrt2)\sin 2x}{(\sqrt2-1)\cos 2x+\sqrt2+1})$$
que es exactamente lo que queremos.