Hay una definición operativa, o de la publicación de un estudio en donde un
definición general es dado, lo que me permite reconocer en un
genérico molécula (o, al menos, una molécula orgánica) si una determinada
bond es giratorio o no?
Depende de su propósito. ¿Por qué desea identificar algunos bonos y llamar a la giratorio? Por ejemplo, PubChem, una de las mayores bases de datos de las moléculas, define rotativo de bonos de la siguiente manera:
Rotativo de bonos se define como cualquier no-anillo de bonos ligados a
no terminal pesado (es decir, no de hidrógeno) el átomo.
En cierta medida, todo esto se reduce a la siguiente definición de la IUPAC de rotación libre:
rotación libre (obstaculizado la rotación, rotación restringida)
En una estereoquímica contexto de la rotación alrededor de un enlace se llama 'libre'
cuando la rotación de la barrera es tan baja que las diferentes conformaciones son
no perceptibles como las diferentes especies químicas en la escala de tiempo de la
en el experimento. La inhibición de la rotación de los grupos acerca de una fianza debido a
la presencia de una lo suficientemente grande de rotación de la barrera para hacer la
fenómeno observable en la escala de tiempo del experimento se denomina
obstaculizado la rotación o rotación restringida.
En las habituales condiciones de laboratorio una rotación alrededor de un solo no-anillo de bonos, limitada a no terminal átomo pesado va a ser, de hecho, casi gratis, por lo tanto, PubChem definición puede ser utilizado como una muy simple regla-de-pulgar para identificar dichos bonos. Pero en general depende de las condiciones. Y los efectos.
Con respecto a las redes troncales de proteínas, siendo giratorio o no: yo no soy un speacialist en esta área, pero el artículo de la Wikipedia sobre el enlace peptídico afirma que (el énfasis es mío)
Importante deslocalización del par solitario de electrones en la
átomo de nitrógeno proporciona al grupo un parcial de doble enlace carácter. El
parcial de doble enlace hace que el grupo amida plana, que se producen en
el cis o trans isómeros.
Así, esta parcial de doble enlace personaje puede contribuir en redes troncales de proteínas, no siendo bastante giratorio. Además, el artículo de la Wikipedia también dice que (el énfasis de nuevo la mía):
En el estado desplegado de las proteínas, los péptidos grupos son libres de
isomerize y adoptar ambos isómeros; sin embargo, en el estado plegado, sólo un
solo isómero que se adopte en cada posición (con raras excepciones).
Así, al menos en el estado desplegado redes troncales de proteínas son rotativos. El hecho de que sólo dos configuraciones (cis y trans) es irrelevante. La noción de rotativo de bonos no implica tener algunas de las configuraciones posibles.
